У нашей организации существует несколько Подразделений, вследствие чего приняли решение вести учет по Складам (а не по подразделениям, потому как они встречаются в большей части документов конфигурации), добавили в субконто счетов Склады и всем довольны.
По обработке: Выбираем внизу формы нужный нам склад и формируем.