Проверка соответствий данных (справочники и документы) в синхронизируемых базах УТ 11.2 и БП 3

После перехода на УТ 11.2 в ноябре 2015 имеем проблемы с синхронизацией. Выяснилось, что иногда при обмене в Бухгалтерии затирается существующая номенклатура новой (остается только GUID от старой) а старая вновь создается с новым GUID (при этом создаются записи в РС ПубличныеИдентификаторыОбъектов). Базы переданы в 1С для разбирательств, но сейчас нужно оценить масштабы бедствия. В связи с чем необходима обработка, которая покажет различия в базах по справочникам номенклатуры и контрагентов, а также проведет сверку по документам реализации, поступления и банковским документам.
База УТ 11.2 была создана с нуля, выгрузкой из Бух 3, в работе данные вводятся в одну из баз, т.е. практически все элементы справочников и документы должны иметь одинаковый GUID в базах (исключение составляют банковские документы, которые иногда загружались из банка и в УТ и в Бух). Но в связи с ошибками в синхронизации, регистр ПубличныеИдентификаторыОбъектов всё же заполнен, поэтому необходимо его учитывать при сопоставлении данных.
Итак, для справочника Номенклатура, поля для проверки: Наименование, Код.
Контрагенты: Наименование, ИНН, КПП.
Поступление и Реализация: Номер, Дата, Контрагент GIUD, Табличная часть товары: Номенклатура GIUD, количество, сумма.
Списание и Поступление безналичных денежных средств: Номер, Дата, Контрагент GUID, Сумма.
Документы сверять за определенный период, справочники - все записи.