Обработка "Удаление помеченных объектов" использует стандартную обработку "удаление помеченных объектов с отбором по метаданным"
только добавлена возможность быстрого старта (при открытии сначала выбираются метаданные и только потом ищутся помеченные на удаление объекты)
Также при невозможности удалить какой то объект (например стоит какой то зарпрет на редактирование) обработка идет дальше, а не останавливает работу как стандартный метод в 1с (В меню "операции" - "удаление помеченных объектов")