Чтобы включить надбавку в совокупную тарифную ставку нужно открыть раздел Настройка->Расчет зарплаты->Показатели определяющие состав совокупной тарифной ставки.
В левой таблице мы находим нужную надбавку и при помощи кнопки > (либо двойного клика) перемещаем ее в правую часть экрана.
Однако это действие не дало результата.
На партнерском форуме была дана рекомендация проверить ФОТ(Фонд Оплаты Труда). Однако у нас он был заполнен.
Проблема оказалась в следующем:
В регистре сведений Плановый ФОТ итоги была старая совокупная ставка, включающая только оклад.
Для того чтобы обновить ее нужно использовать служебную обработку Пересчет планового ФОТ. Найти ее можно в разделе Зарплата-> Сервис.
Откроется обработка по пересчету ФОТ. Указываем, что нужно сделать пересчет по всем сотрудникам с нужной даты и нажимаем кнопку Пересчитать ФОТ. После этого данные в регистре обновятся и совокупная ставка рассчитается верно.