1. Для этого надо при запуске клиента в терминальной сессии получить многопользовательскую лицензию "На этот компьютер" в варианте "Всем пользователям данного компьютера". То есть ввести пинкод из Комплекта пинкодов для многопользовательской лицензии.
При запуске в терминальной сесии толстые клиенты 1С:Предприятия 8.2 могут сами находить файл с лицензией и определять, какое количество лицензий в данный момент доступно. Использование сервера 1С:Предприятия или веб-сервера для выдачи лицензии в такой ситуации не требуется.
2. Необходимо перенести файл лицензии из каталога C:\Documents and Settings\All Users\Application Data\1C\1Cv82\conf в каталог conf установленной 1С (может и не обязательно, но у меня заработало только после этого).