Вместо заголовка ОС появляется серая полоска, соответствующая высоте заголовка окна, см. рис.
Вот что написано в ИТС по этому поводу.
Главное окно приложения может отображаться в двух вариантах:
1. Без заголовка окна операционной системы (рис.52). Этот вариант используется в том случае, если клиентское приложение работает под управлением ОС Windows, не в терминальном режиме и не в режиме удаленного рабочего стола. В этом случае заголовком окна является главная панель.
2. С заголовком операционной системы. Этот вариант используется при работе в операционных системах Linux и macOS, при использовании веб-клиента, а также при работе под управлением ОС Windows в терминальном режиме или в режиме удаленного рабочего стола. В этом случае главная панель расположена под заголовком ОС.
Переключение вариантов отображения главного окна приложения выполняется автоматически, в зависимости от того, в какой ОС и каком окружении запускается клиентское приложение. Кроме того, при работе клиентского приложения в ОС Windows имеется возможность управления отображением заголовка ОС с помощью методов ПолучитьОтображениеЗаголовкаОС()/УстановитьОтображениеЗаголовкаОС() объекта КлиентскоеПриложение. Установить отображение заголовка окна ОС можно только в обработчике события ПередНачаломРаботыСистемы.
Резюме
Проблема в RemoteApp решается принудительным включением окна ОС.
Процедура ПередНачаломРаботыСистемы()
КлиентскоеПриложение.УстановитьОтображениеЗаголовкаОС(Истина);
КонецПроцедуры
Для тех у кого нет доступа к конфигуратору, выложил исправление в расширении
Для установки расширения необходимо в режиме предприятия открыть Администрирование->Печатные формы , отчеты и обработки->Расширения
После запуска в терминале вид заголовка становится вот такой. Указатель мыши отрабатывает корректно.
Расширения протестированы на релизах Бухгалтерия 3.1 3.0.79.11, ЗУП 3.1 3.1.14.61, Документооборот КОРП 2.1.22.8.
UPD 19.08.2020
На bugboard появилось описание этой ошибки
https://bugboard.v8.1c.ru/error/000069536
UPD 22.10.2020
Заменил расширение для ЗУП, поправил обработчик на ПередНачаломРаботыСистемы
