Обработка поможет при дублировании справочников.
При запуске происходит поиск ссылок на справочник, и заменяются все реквизиты документов, справочников, проводок и периодических реквизитов. Если периодический реквизит был создан документом, то документ перепроводится.
У подчиненных справочников можно поменять владельца по флажку.
Например, если вы хотите объединить двух контрагентов в один, то нужно проделать следующее:
Выбираем контрагентов - запускаем обработку (если нужно оставить отдельный договор (расч.счет), то ставим флажок и он будет подчинен новому контрагенту, иначе лучше не ставить для последующего объединения договоров (расч.счетов)). Если нужно объединить договора (расч.счета) в один, то выбираем договора (расч.счета), в обработке и запускаем.
Или наоборот сначала объединяем подчиненные справочники (договора, расч.счета), а затем контрагентов.