Регистрируем внешнюю обработку заполнения табличных частей.
В документе "Корректировка записей регистров" включаем "Заполнение движений" и добавляем строчку с действием "Заполнить остатками регистра"
Нажимаем кнопку "Заполнить движения"
В открывшемся окне выбираем регистр, устанавливаем фильтры
Нажимаем "Выполнить".
Документа заполнится остатками выбранного регистра.