В типовых есть общая форма "ВыборОбъектовМетаданных". Кому лень разбираться, как её прикрутить к внешней обработке или отчету в качестве встроенной формы выбора, - вот пример (Управляемые формы).
Внешняя обработка с доработанной системой выбора объектов метаданных из дерева. Возвращает список выбранных объектов. Механизм можно перенести любую необходимую форму. Параметры вызова окна дерева хорошо описаны.
Дерево метаданных строится из наличия таковых в любой конфигурации для версии 8.2 и выше. Возможность изменять состав дерева настройками и программно. Режим множественного и одиночного выбора.