Опытным путем выяснили, что для точного отражения документов необходимо документ сначала распровести, а затем провести заново.
Для решения данной проблемы мы доработали стандартную обработку проведения документов 1С ERP Управление предприятием 2.0, добавив возможность предварительно распроводить документ, а затем проводить его заново автоматически.
Тестировали на платформе 1С:Предприятие 8.3 (8.3.10.2466) конфигурация 1С:ERP Управление предприятием 2 (2.2.4.19)