1) с помощью формы справочника «выявляются» метаданные конфигурации, их реквизиты.
2) в ней интерфейсно устанавливаются флажки "что надо контролировать" (можно установить флажок сразу на все реквизиты более нижнего уровня).
3) сохраняем значения флажков (в регистре сведений будет лежать эта служебная информация).
4) при записи (по подписке) делается регистрация того что изменилось (из того что надо контролировать)...
...все :)
5) Журнал изменений (форма регистра сведений) позволяет просматривать, искать, отбирать (отбор по GUID - позволяет узнать историю конкретного объекта), открывать объект (если он, конечно, еще существует в БД), также можно узнать кто когда с какого компьютера внес изменения в реквизит, который стоит у нас на контроле.