В модуле документа счет-фактура выданный начиная со строки 4577 (релиз УТ 10.3.32.2) видим код:
Для Каждого СтрокаСчетаФактуры Из ДанныеДляПечати.ТабличнаяЧасть Цикл
СтрокаСчетаФактуры.Сумма = СтрокаСчетаФактуры.Сумма * Курс / Кратность;
СтрокаСчетаФактуры.СуммаНДС = СтрокаСчетаФактуры.СуммаНДС * Курс / Кратность;
КонецЦикла;
В модуле РТиУ сумма НДС считается с округлением (строка 371), дальше не смотрел - видно, что при пересчёте у.е. в рубли округление есть:
Если СуммыВРублях Тогда
Сумма = Сумма + СуммаРуб;
СуммаНДС = СуммаНДС + Окр( ВыборкаСтрокТовары.СуммаНДС * КоэфКурса, 2, 1);
Иначе
Сумма = Сумма + ВыборкаСтрокТовары.Сумма;
СуммаНДС = СуммаНДС + ВыборкаСтрокТовары.СуммаНДС;
КонецЕсли;
Результат - сумма по счет - фактуре без НДС и всего могут расходиться с теми же суммами в ТОРГ-12, что реально призошло у клиента.
Дальше не копал, с помощью обработки "Конструктор внешних печатных форм" от SeiOkami (//infostart.ru/profile/309462/ SeiOkami@yandex.ru vk.com/SeiOkami) сваял ВПФ, в модуле которой изменены две строки:
Для Каждого СтрокаСчетаФактуры Из ДанныеДляПечати.ТабличнаяЧасть Цикл
СтрокаСчетаФактуры.Сумма = Окр(СтрокаСчетаФактуры.Сумма * Курс / Кратность, 2);//ЕАЮ добавил округление
СтрокаСчетаФактуры.СуммаНДС = Окр(СтрокаСчетаФактуры.СуммаНДС * Курс / Кратность, 2); //ЕАЮ добавил округление
КонецЦикла;
На печать теперь выводятся одинаковые суммы :-)
В принципе, если конфигурация уже пилёная, можно исправить модуль счет-фактуры...