Делалось и тестировалось на Бухгалтерия предприятия, редакция 2.0 (2.0.62.4)
Номенклатура не создается, а ищется по наименованию из файла. По логике раз вы отдали на комиссию - то товар у вас в базе уже есть. Я б в принципе сделал подгрузку товара - но для этого в унифицированной форме нет колонок ед.изм. и код.
Контрагенты ищутся по ИНН, в случае отсутствия создаются.
Установка - меню: сервис - дополнительные отчеты и обработки, дополнительные внешние обработки табличных частей.
Добавляете новую и подгружате из файл. После чего заполнение будет доступно по кнопке "заполнить" в документе отчет комиссионера над табличной частью "товары".
Делалось для примера, файл которого прилагаю.
14.04.2015 - обновлен файл обработки. Теперь автоматически создаются счета-фактуры, если заполнена колонка с номером сч.ф.
Внимание: сч.ф. ищется по номеру и обновляется, учтите это что бы номера не пересеклись с другими сч.ф.!