Порядок действий:
1) Открываем файл внешней обработки через меню файл-открыть
2) Добавляем документ: один или несколько поступлений либо реализаций
3) Жмем кнопку "перезаполнить товары". Из документов в табличную часть обработки перенесуться товары.
4) Если требуется жмем "пересчитать". Например если надо сделать наценку 10%, то ставим процент 110 и жмем на "пересчитать".
5) Если все устраивает, то жмем "ввод на основании". Если что то не так, то просто заново жмем на "перезаполнить товары".
Тестировалось:
1С:Предприятие 8.3 (8.3.12.1790)
Бухгалтерия предприятия, редакция 3.0 (3.0.68.58)