Документы формируются по группе котрагентов с отбором по дополнительному реквизиту "Услуга".
Данный реквизит добавлен к справочнику "Договоры" (наименование - "Услуга", тип значения - "Номенклатура").
Включение дополнителного реквизита: Администрирование - Общие настройки - Доп. реквизиты - Установить курсор на "договор" и в правом поле добавить реквизит.
Т.е. отбор заполнения в табличную часть обработки осуществляется по контрагентам, имеющим договор с услугой, указанной в шапке обработки.
В шапке обработки нужно указать организацию, даты документов "Счет на оплату" и "Реализация товаров и услуг", услугу (должна быть указана в договоре контрагента, если по этому договору необходимо сформировать документы"), группу контрагентов дя отбора, сумму (если она одинакова для всех контрагентов, иначе сумму необходимо заполнить непосредственно в табличной части обработки).