К сожалению, стандартная печатная форма "Заказ покупателя" не поддерживает вывод серий номенклатуры, в результате чего пришлось сделать внешнюю печатную форму с выводом серий номенклатуры.
Для добавления идем в раздел Сервис-->Внешние печатные формы и обработки --> Внешние печатные формы --> "Создать", выбираем нашу ВПФ.
P.S. Серии будут выводиться только в случае, если в настройках параметра учета установлен флаг "Использовать указание серий при резервировании"