При универсальном обмене между базами, в регистр сведений "ПубличныеИдентификаторыСинхронизируемыхОбъектов" записывается GUID (идентификатор) - полученного объекта. Обработка получается эти идентификаторы из сторонней базы, с которой у нас настроен обмен, и сопоставляется с GUIDами текущей базы. Если во внешней базе GUIDа нету в регистре, то соответственно объект не выгружался.
1. В обработке нужно выбрать Настройку синхронизации - из неё мы получим параметры подключения к нужной нам базе (пока реализовано только по COM).
2. Выбираем период (отбор объектов по дате в нашей базе).
3. Выбираем типы объектов, которые хотим сравнить.
Обработка тестировалась на платформе 1С:Предприятие 8.3 (8.3.12.1685), с конфигурациями: Бухгалтерия предприятия, редакция 3.0 (3.0.70.52), Комплексная автоматизация 2 (2.4.7.127), Зарплата и управление персоналом, редакция 3.1 (3.1.9.188).