Вдаваться в подробности не буду - процесс поиска причин медленной работы и порядок оптимизации проблемных процедур полностью аналогичен изложенному в статье "Одна из причин медленной работы табеля".
Если коротко, то анализ статистики СУБД показал на узкое место в отчете Т-13. Все потенциально сложные для оптимизатора SQL вложенные запросы в отчете были преобразованы во временные таблицы (иногда с индексацией).
В результате доработки на моей базе время обработки тестовой выборки уменьшилось с ~600 до ~50 секунд, т.е. было получено приблизительно 12-кратное ускорение.
Если интегрировать доработанный отчет непосредственно в базу, то изменения затронут также и печатную форму "Т-13". В данном случае наблюдалось ускорение от 2х до 5x, т.к. в этом случае не задействуется запрос из схемы компоновки данных.
ЗУП 2.5.101.2 (8.2.19.83), MS SQL Server 2005 (9.00.4053.00, 64-bit)
(аналогичные результаты в вашей рабочей среде не гарантируются, например, у меня в аналогичной базе, но на 10-ой версии SQL-сервера результат был не такой впечатляющий, приблизительно 2x)