В Пункт "Комплект" выбрать необходимый комплект отчетности, в который нужно внести изменение (дабавить либо удалить пачку).
В пункт "Пачка" выбрать нужную пачку.
После выбора действия нажать Выполнить.
Если открыто окно 1С с корректируемым комплектом, переоткрыть его, чтобы увидеть изменения
PS. Обработка изменяет только состояние одного объекта в базе, но все равно делаем сначала все в копии базы.