Оптимальное решение: ежемесячно переносить начисления суммами, приемы, перемещения, больничные, отпускные. Это достаточно, чтобы формировать отчеты в ПФ (СЗВ, РСВ), ФСС, 2-НДФЛ.
За одно:
а) "тетки" привыкают к программе 1С, когда то все равно перейдут;
б) будет у них к этому времени база для начисления больничных и отпускных.
Обработка для внедренцев 1С. Предварительно необходимо загрузить справочники сотрудников и физлиц, должности, подразделения, виды начисления. Настроить в ЗУПе виды начисления (налогооблажение), должности (для ПФ), в подразделениях проводки. Элементы справочников "стыкуются" по кодам, не найденные создаются.