Алгоритм использования обработки весьма прост:
1) Заполняем документ "Зарплата к выплате организации" стандартными средствами документа.
2) Запускаем обработку через меню таблицы "Заполнить->Удалить не из группы".
3) В открывшемся списке выбираем группу справочника сотрудники, членов которой следует оставить в документе.
4) "Ок". Сотрудники не состоящие в указанной группе удаляются.
Использовать обработку можно, например, в случае когда ЗП начисляется всем сотрудникам одним документом, но часть сотрудников не являющихся частью одного подразделения, получает ЗП на личные карты, часть по зарплатному проекту, а часть наличными. В таком случае сотрудников удобно организовать в группы и использовать эту обработку.