Один из многих вариантов решения ошибки "Нарушена целостность структуры конфигурации".
Если Вам довелось столкнуться с этой ошибкой обратитесь к специалисту 1С однозначно. Вариантов решения много, но от ситуации и источника проблемы - решения совершенно разные.
Предлагаю вашему вниманию одну из таких ситуаций.
Описание задачи:
Обновление конфигурации произошло автоматически. При запуске 1С режиме конфигуратор имеем сообщение "Нарушена целостность структуры конфигурации". При автообновлении конфигурацию поставщика обновить корректно не получилось. Запуск в пользовательском режиме выдает ошибку ссылаясь на модуль в конфигурации.
Во первых необходимо очистить кеш. В ОС Windows 7 находиться C:\Users\Администратор\AppData\Roaming\1C\1Cv82 и C:\Users\Администратор\AppData\Local\1C\1Cv82 (Win7x64). После очистки кеша 1С запуститься в режиме конфигуратора. При попытке открыть конфигурацию 1С вылетает. Выгрузить информационную базу в файл для подстарховки. Тестирование и исправление не помогает. Утилита проверки файловой базы говорит, что ошибок нет. Пункты меню загрузки, выгрузки конфигурации, поддержки и т.п. без открытой конфигурации не активны. Доступна сохранение конфигурации данных - это значит что данные не уничтожены, что является главным..
Так же из конфигуратора в пользовательский режим в режиме отладки может запуститься, а возможно и нет, это не влияет на ситуацию.
Попытка загрузить информационную базу в SQL не приведет к положительному результату.
И тут появляется мысль что можно было бы поставить крест на базе... подняться из древнего бекапа если таковой имеется... и напрягаться с восстановление данных вручную.
Решение:
1. Необходима чистая конфигурация той же версии - рабочая.
2. Очиста кеша полная (указано выше).
3. Запускаем чистую базу в режиме конфигуратора и открываем конфигурацию. При этом 1С создает ее кеш в C:\Users\Администратор\AppData\Local\1C\1Cv82 (набор файлов и папок в папке с ID конфигурации.) так же нам нужен кеш C:\Users\Администратор\AppData\Roaming\1C\1Cv82. Можно просто переименовать данные папки после закрытия 1С.
4. Запускаем наш не рабочую базу в режиме конфигуратора и смотрим кеш. И в результате имеем две папки с ID конфигурации (Живой и Мертвой).
5. Закрываем все и подменяем кеш мертвой конфы на живую полностью. Т.е. удаляем текущую и заменяем ранее переименованной папкой.
6. Запускаем не рабочую базу в режиме конфигуратора И ВОТ первый успех - дерево конфигурации открыто, разделы меню управления конфигурацией активны.
7. Идем в управление поддержкой, и снимаем с поддержки полностью. сохраняем, обновляем. Можно обновить через файл конфигурацией рабочей базы.
8. Удалем кеш полностью.
9. Запускаем не рабочую базу в режиме конфигуратора, пытаемся открыть конфигурацию - все открывается, ошибки нет.
10. Запускаем 1С. Все доступно. Данные на месте.
Вот еще вариант спасения предложенный пользователем инфостара Tavalik:
1. "Конфигурация" - "Конфигурация базы данных" - "Вернуться к конфигурации БД"
2. "Конфигурация" - "Обновить конфигурацию баз данных"