В типовой обработке добавлено меню "Расширение" с возможностью вызова формы настроек (там-то и задаются алгоритмы), функции подбора запросом, выполнения алгоритма 1 или 2.
В форме настроек как раз есть закладки для запроса (тут работает конструктор запроса), Алгоритм1 - просто код, Алгоритм 2( тоже просто код).
В справке добавлено описание возможностей.
*Не смотря на то, что Релиз "Альфа" пользоваться вполне можно.
Иногда выдаются технические ошибки (например, если в выборе алгоритма отменить выбор). Данные ограничения не влияют на работу обработки. Просто писал ее для работы и небыло времени чистить хвосты. Со временем, выложу почищенную.
В релиз заложен бонус: Запрос на поиск задублированных элементов справочника, его легко адаптировать под требуемый справочник. Алгоритм удаления объектов, которые были заменены.