Столкнулся с такой ситуацией в клиент-серверном варианте:
При проведении платежки, она не видела ни одного документа расчетов (хотя их было опупеть как много и все не закрытые) и в итоге в качестве документа расчета подставляла сама себя.
После многократного перепроведения этого документа, полез в конфигуратор, нашел запрос, которым подсчитывались итоги. Оказалось, что в запросе для невалютных счетов стоит отбор Валюта = Неопределено, , а в регистре Хозрасчетный каким-то чудом записалась Валюта = ...ПустаяСсылка(), в итоге он не видел такие документы. Помогла простая перезапись наборов с отбором по регистратору без перепроведения регистратора. С таким столкнулся пару месяцев второй раз. Источник ошибки не смог отследить, т.к. повторно ошибка не воспроизводилась.
Вступайте в нашу телеграмм-группу Инфостарт