Для удаления кеша 1С и сохранения при этом настроек пользователя можно использовать следующий скрипт (для Win 7 и выше):
DEL /F /S /Q /A %USERPROFILE%\AppData\Roaming\1C\1Cv8\*cache*
DEL /F /S /Q /A %USERPROFILE%\AppData\Local\1C\1Cv8\*cache*
Выделенный фрагмент нужно изменить на правильный (т.е. у вас может быть 1Cv82, 1Cv83)
Его можно поместить к событию Log on как локально так и в групповой политике контроллера домена.