При переходе столкнулись с тем что часть данных не перенесена. Данная обработка переносит указанные регистры.
Запускаем обработку в редакции 3.1, указываем параметры подключения к данным 2.5 и получаем готовый документ "Перенос данных"
Тестировалось на релизах 3.1.8.216 и 2.5.130.2.