99% изменений внесено в саму форму регл. отчета и всё же чуть чуть пришлось попавить модуль стандартной обработки "БухгалтерскиеИтоги", смотрим скриншот. (У справочника ПодразделенияОрганизации нет групп, но он всё же иерархический, пришлось малость схитрить). Если у вас нет иерархии в подразделениях, то править обработку "БухгалтерскиеИтоги" не нужно!
И еще, как выяснилось, не у всех счетов есть признак учета по Подразделениям, например, у 19го счета, а он используется при расчете. Кому надо добавляем признак учета на счетах и, возможно, дописываем закрытие месяца и прочие механизмы. Пока не разбирался...
Оказалось всё очень просто, а я думал, залезу в такие дебри! Ясно дело, что при каждом выходе новой формы баланса (надеюсь это будет не часто) придется править его по образу и подобию, но опыт-то уже есть ;)
Если кому будет полезно, буду рад.
P.S. Моя первая публикация тут ;)