Для создания счет-фактуры нужно указать документ Реализация товраов и услуг.
В результате выполнения обработки будет создан документ "Счет-фактура выданный".
Откроется окно структуры подчиненности документа РТиУ с новым документом Счет-фактура выданный.
Проверено на УПП 1.3.96.1.