Представляю вашему вниманию на мой взгляд удобный отчет по регистру бухгалтерии Хозрасчетный для поиска отрицательных остатков по всем счетам с поиском документа, после которого образовался отрицательный остаток.
В отчете выводятся строки с аналитикой счета и подразделением, где присутствует отрицательный остаток на конец периода по сумме и количеству, а также документ, после которого образовался отрицательный остаток в заданном периоде.
Тестировалось на Бухгалтерии предприятия КОРП, редакция 3.0 (3.0.128.15).
Отчет можно подключить к конфигурации через Администрирование/Печатные формы, отчеты и обработки.