Документ "установка цен".
Обе цены должны быть уже включены в документ.
Отрицательный процент уменьшает цену, нулевой процент просто копирует цену из одной в другую.
Можно подключить как внешнюю обработку.
Проверено на версии УТ 11.1.10.131
Если будут пожелания по изменению - пишите.