Бывает, что в документе Премия формируются какие то левые перерасчеты, которые удалить просто так нельзя.
Сделал обработку, она хоть и простая, но полезная. Просто выбираем документ премии и жмем "Сделать".
Проверено на релизе: Зарплата и управление персоналом, редакция 3.1 (3.1.3.157).
Можно добавить как внешнюю обработку табличной части.