Отчет сформирован на СКД, не требует учета по партиям. Запрос строится по проводкам 41-го и 90-го счетов (внутреннее соединение), условие на совпадение регистратора и номенклатуры. Создал три варианта отчета: "Основной" (группировка по покупателям и номенклатуре), "ПоНоменклатуре" и "Шахматка", в каждом из них создал быстрые отборы (типа номенклатура, номенклатурная группа), но отчет на СКД, так что поле для творчества имеется. В варианте "ПоНоменклатуре" добавил условное офомление, при условии отрицательной прибыли, строка выводится розовым цветом, удобно для поиска ошибок. Отчет можно открывать как внешний файл, а можно зарегистрировать во внешних отчетах.
В моем случае имеется торговая организация (опт), основной документ продажи "РеализацияТоваровУслуг", отчет отлично отработал. Если имеются возвраты, должен тоже отработать, а вот по ручным проводкам не уверен.
На универсальность не претендую, если кому-то сгодится буду рад. Похожие отчеты здесь видел, но либо платные, либо не для России.