Решение сделано в виде внешней печатной формы к документу "Ведомость на выплату зарплаты в банк". Формируем печатную форму и сохраняем ее штатными средствами (нажав на дискетку) в формате Excel, структура формата соответствует новому образцу, разработанному банком. При загрузке в банк клиенте автоматически разносятся данные из сформированного файла.
Необходимо в документе указать зарплатный проект, где должны быть заполнены поля Номер (указать Идентификационный номер клиента) и Расчетный счет, как показано на скрине. Необходимо также задать номер контракта.
Проверено на 1С:Зарплата 8, релиз 3.1.22.77.