Обработка разбирает текст в поле "назначение платежа" (сейчас корректно разбираются операции, полученные по эквайрингу от банков Сбербанк и Зенит, при желании вы можете написать свой алгоритм разбора - код обработки полностью открыт) . Также в коде обработки есть пример по отключению проведения по УСН (по умолчанию отключен)
Обработка не может претендовать на универсальность, но может служить шаблоном для автоматизации подобных операций.
Для использования обработки нужно внести обработку в раздел Администрирование / Печатные формы, отчеты и обработки / Дополнительные отчеты и обработки. В обработке используется авторегитсрация как регламентное задание (само расписание нужно указать в ручную в зависимости от ваших требований). Также имеется возможность запускать обработку в обычном режиме (опция может быть востребована при отладке).
Работа обработки проверялась на версии 1С Бухгалтерия КОРП 3.0.50.12, но должна работать и на других редакциях 1С:Бухгалтерия 3.
P.S. Update 29.01.2019
Обновление обработки (у меня работает с релизом бп корп 3.0.65.91 и банком Сбербанк)
Выполняются 3 задачи:
1. В документах "поступление на расчетный счет" с комментариями, содержащими слова "комиссия:","эквайринг","удерж","комис" - выделяется комиссия.
2. Для ситуаций п.1 убираются движения в РегистрНакопления.КнигаУчетаДоходовИРасходов
3. В документах "поступление на расчетный счет" с комментариями, содержащими слова "инкассация" заполняется СтатьяДвиженияДенежныхСредств с наименованием "инкассация".
Перед использованием проверьте работу на копии, при желании адаптируйте под себя.