Единственное условие, по умолчанию цифра в отчете не отображается. В связи с этим необходимо из Настройки к отчету добавить реквизит "НДФЛ перечисленный" (Это освязано с хранением настроек в двоичном макете, до которого пока дойти не смог).
Ну а разницу между удержанным и перечисленным можно расчитать через настройку пользовательских полей.