Отчет будет работать на любой конфигурации, где есть регистр накопления "Товары на складах".
Результат СКД можно сохранить в таблицу значений для дальнейшего использования.
Все найденные мной публикации на тему остатков на каждый день (даже когда не было оборотов) были очень сложными. Например, вот эта.
Предлагают сделать отдельный массив дат и получать остатки с оборотами на каждую дату, а затем объединить результат, или что-то сложное в СКД (ввести какие-то параметры, связанные наборы данных), или кучу вложенных подзапросов.
Мое решение будет понятно даже человеку, далекому от СКД. В любом случае результат работы СКД можно сохранить в таблицу значений. Ничего нового в этом отчете нет, просто самое простое решение, на мой взгляд.