1) Выбираем документ Расчет компенсации родительской платы, заполняем Счета, КБК и КЭК дебета и кредита, выбираем пустой документ Операция (или Расчёт компенсации родительской платы) жмём кнопочку Начислить и, некогда пустая, Операция (или Расчёт компенсации родительской платы) уже делает нам проводки по нужным счетам (В моём случае дт 401.20 кт 302.62) по-фамильно.
2) На закладке Оплата поступаем аналогичным образом, жмём кнопочку Заполнить оплату и, некогда пустой, документ Кассовое выбытие уже делает нам проводки по оплате (проводка в моём случае Дт 302.62 Кт 201.11 Заб Кт 18.01, суммы и фамилии берутся из документа Расчет компенсации родительской платы)
3) На закладке Выгрузка выбираем путь и имя файла, жмём кнопочку выгрузить и формируется реестр для зачислений на карты в формате CSV.
P.S. После заполнения настройки рабочих счетов можно и сохранить настройки, чтобы в следующий раз по новой всё не выбирать.
Тестировалось на 1С:Бухгалтерия государственного учреждения, редакция 1.0 (1.0.46.5).